Sekcja Zarządzania Zbiorami odpowiada za zakup i opracowanie zbiorów drukowanych i elektronicznych, prowadzenie wymiany międzybibliotecznej oraz obsługę magazynów zamkniętych. Zajmuje się przyjmowaniem darów, selekcją i ubytkowaniem zbiorów, ich konserwacją i oprawą, a także przygotowywaniem materiałów do udostępniania.